Bienvenidos a su curso de farmacoinformática.

En este repositorio encontrarán el contenido e instrucciones para trabajar en las sesiones preparadas de acuerdo al programa del curso.

1. Para iniciar deben primero deben acceder a la máquina Chernobyl del RamirezLab. Debemos escoger un puerto para abrir la interfaz gráfica, para esto escogemos un número único de cuatro cifras (####) que se usará en adelante. El comando de acceso es:

   ssh -L ####:localhost:#### [email protected]

   (recuerde cambiar #### por el número escogido) (passwd: ramirezlab2022):

2. Ahora, deben activar el ambiente de trabajo usando el comando

   conda activate farmacoinformatica

   Este ambiente se encuentra en

   Farmacoinformatica-2022/00-Documentos/00-env/env.yml

3. Luego, deben acceder a la carpeta Farmacoinforamtica-2022 con el siguiente comando

   cd Farmacoinforamtica-2022

4. Posteriormente, deben crear una carpeta con su apellido y nombre, sin usar espacios ni signos de puntuación, por ejemplo:

   mkdir Ramirez_David

5. Luego accedan a la carpeta con el comando cd

   cd Ramirez_David

6. Posteriormente, deben clonar este repositorio en su carpeta personal así:

   git clone https://github.com/ramirezlab/Farmacoinformatica-2022.git

7. Ahora deben iniciar el servidor para poder trabajar con Jupyter notebook.

   jupyter notebook --no-browser --port=####

   (recuerde cambiar #### por el número escogido)

   Después de este comando, deben copiar el token para usarlo en los siguientes pasos.

   Ejemplo:

   Jupyter Notebook 6.4.11 is running at:

   [I 17:51:58.257 NotebookApp] http://localhost:####/?token=0d47af2913ba0a8d65b8aa64933de2118299af2b918fc256

   El token en este caso sería:

   0d47af2913ba0a8d65b8aa64933de2118299af2b918fc256

8. Lo siguiente es abrir cualquier navegador dentro del computador personal. Con esto abriremos la interfaz de jupyter mediante la tunelización. En el navegador:

   localhost:####

   (recuerde cambiar #### por el número escogido)

   Finalmente, la interfaz de jupyter nos pedirá un código de acceso llamado token, el cual se encuentra en el numeral 7.

De esta forma tendra activo Juputer notebook y podrá realizar las sesiones donde se emplee este servidor.

Ahora, en el navegador acceda a la carpeta creada al clonar este repositorio, y a la sesión de trabajo correspondiente.

Have Fun!!!