Programme R pour créer des analyses des décèes en Europe.
Ce projet a pour vocation de télécharger les données en temps réel depuis les fournisseurs de données officiels.
Utiliser au choix :
-
RStudio : Facile à installer, mais IHM plus figée
-
Eclipse : Plus complexe à installer, mais plus puissant (si on connaît déjà Eclipse) et configurable (Colorisation Syntaxique)
- installer R
- installer Plugin StatET et
- suivre les instructions sur https://gitlab.com/walware/de.walware.rj-server.gr/-/wikis/Installation (a exécuter dans R)
- Installer Pandoc (https://pandoc.org/installing.html ou utiliser celui installé par RStudio) pour la génération Knitr
- Configurer l'appel à Knitr et Pandoc : https://www.r-bloggers.com/2017/10/processing-rmarkdown-documents-with-eclipse-and-statet/
- Après l'install de l'ensemble, rebooter Windows !
- Ressources Eclipse/StatET
La toute première fois, exécuter ceci pour installer les librairies :
- 000_install_libraries.R
Ensuite, pour tout exécuter :
- 002_run_all.R
Par la suite, pour exécuter ou ré-exécuter certains fichiers :
- 010_creation_tables_deces_europe.R
- 020_analyses_eurostat.R
- 030_analyse_deces_hebdomadaires.R
- 040_deces_francais.R
- 050_delivrance_medicaments.R
- 060_SIRD.r
Pour générer l'article en HTML, executer ensuite :
- 110_la_mortalite_en_europe.Rmd
Puis générer le HTML avec le bouton "Knit to HTML" :
- 110_la_mortalite_en_europe.Rmd
Conventions de nommage des variables :
- es_ : EuroStat
- eu_ : www.ecdc.europa.eu
- owid_ : OurWorldInData