Add spdx identifiers

src/blue_cwl/__init__.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """blue_cwl."""
 
 from importlib.metadata import version

src/blue_cwl/brain_regions.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Brain regions helper functions module."""
 
 import importlib

src/blue_cwl/cli.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Workflow wrappers."""
 
 import logging

src/blue_cwl/connectome.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Connectome assembly of macro and micro connectome matrices.
 
 All matrices are comprised of columns, a subset of which is the index columns and the rest the

src/blue_cwl/constants.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Constants."""
 
 DEFAULT_CIRCUIT_BUILD_PARAMETERS = {

src/blue_cwl/core/__init__.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Core module."""
 
 from blue_cwl.core.parser import parse_cwl_file

src/blue_cwl/core/command.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Local/Remote command building and execution."""
 
 import logging

src/blue_cwl/core/common.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Common."""
 
 import json

src/blue_cwl/core/config.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Config definitions."""
 
 from typing import Literal

src/blue_cwl/core/cwl.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """CWL workflow construction module."""
 
 import logging

src/blue_cwl/core/cwl_types.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Types module."""
 
 import enum

src/blue_cwl/core/environment.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Environment related utilities."""
 
 from pathlib import Path

src/blue_cwl/core/exceptions.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Exceptions module."""
 
 

src/blue_cwl/core/executor.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """CWL Executors."""
 
 import abc

src/blue_cwl/core/parser.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Parsing module for cwl files."""
 
 import logging

src/blue_cwl/core/process.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Executable Process creation module."""
 
 import logging

src/blue_cwl/core/resolve.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Parameter resolving utils."""
 
 import re

src/blue_cwl/core/types.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Common types."""
 
 import os

src/blue_cwl/core/utils.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Utilities."""
 
 import functools

src/blue_cwl/core/validate.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Validation utils."""
 
 import json

src/blue_cwl/density_manipulation.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """DensityManipulation of nrrd files."""
 
 import copy

src/blue_cwl/exceptions.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """CWL Registry Exceptions."""
 
 

src/blue_cwl/hashing.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Hashing."""
 
 from hashlib import sha256

src/blue_cwl/me_model/__init__.py

@@ -1 +1,3 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """me_model init."""

src/blue_cwl/me_model/entity.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Entities."""
 
 from entity_management.config import MEModelConfig as _MEModelConfig

src/blue_cwl/me_model/recipe.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """MEModel recipe generation."""
 
 import hashlib

src/blue_cwl/me_model/staging.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Staging module."""
 
 from copy import deepcopy

src/blue_cwl/mmodel/__init__.py

@@ -1 +1,3 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """MModel."""

src/blue_cwl/mmodel/config.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Config splitting function."""
 
 from copy import deepcopy

src/blue_cwl/mmodel/entity.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Entities."""
 
 from entity_management.core import Entity

src/blue_cwl/mmodel/overrides.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Topological synthesis inputs overrides."""
 
 from copy import deepcopy

src/blue_cwl/mmodel/recipe.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Utils for building mmodel tool inputs."""
 
 from pathlib import Path

src/blue_cwl/mmodel/schemas.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Schemas."""
 
 import hashlib

src/blue_cwl/mmodel/staging.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Staging utils for mmodel."""
 
 from functools import partial

src/blue_cwl/model.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Custom Base Model for pydantic classes."""
 
 import pydantic

src/blue_cwl/nexus.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Nexus stuff."""
 
 import logging

src/blue_cwl/population_utils.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Functions applied on libsonata populations."""
 
 import libsonata

src/blue_cwl/recipes.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Construction of recipes for circuit building."""
 
 import itertools

src/blue_cwl/registering.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Registering utilities."""
 
 from pathlib import Path

src/blue_cwl/staging.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Staging utils."""
 
 import logging

src/blue_cwl/statistics.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Composition summary statistics."""
 
 import logging

src/blue_cwl/testing.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Testing resources."""
 
 import os

src/blue_cwl/typing.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Typing related definitions."""
 
 import os

src/blue_cwl/utils.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Utilities."""
 
 import functools

src/blue_cwl/validation.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Validation functions."""
 
 from importlib import resources

src/blue_cwl/variant.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Variant entry."""
 
 import importlib.resources

src/blue_cwl/wrappers/__init__.py

@@ -1 +1,3 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """circuit-build wrappers."""

src/blue_cwl/wrappers/cell_composition_manipulation.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Composition manipulation."""
 
 import logging

src/blue_cwl/wrappers/cell_composition_summary.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Cell composition summary app."""
 
 import logging

src/blue_cwl/wrappers/connectome_filtering_synapses.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Synapse filtering module."""
 
 import copy

src/blue_cwl/wrappers/connectome_generation_placeholder.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Connectome manipulation wrapper."""
 
 import copy

src/blue_cwl/wrappers/density_calculation.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Density calculation app."""
 
 import multiprocessing

src/blue_cwl/wrappers/memodel.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """me-model wrapper."""
 
 import logging

src/blue_cwl/wrappers/mmodel.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Placeholder emodel assignment."""
 
 import logging

src/blue_cwl/wrappers/neurons_cell_position.py

@@ -1,3 +1,5 @@
+# SPDX-License-Identifier: Apache-2.0
+
 """Morphoelectrical type generator function module."""
 
 import logging