Skip to content
New issue

Have a question about this project? Sign up for a free GitHub account to open an issue and contact its maintainers and the community.

By clicking “Sign up for GitHub”, you agree to our terms of service and privacy statement. We’ll occasionally send you account related emails.

Already on GitHub? Sign in to your account

Warnings of pandas 2.1.0 [BUG] #99

Open
1 task done
johentsch opened this issue Sep 5, 2023 · 0 comments
Open
1 task done

Warnings of pandas 2.1.0 [BUG] #99

johentsch opened this issue Sep 5, 2023 · 0 comments
Assignees
Labels
bug Something isn't working

Comments

@johentsch
Copy link
Owner

johentsch commented Sep 5, 2023

Once again annoying warnings by annoying changes to the pandas library. Found when performing ms3 review -M -N -X -F -D -c v1.0 on DCMLab/wagner_overtures@7a6f63e

.fillna() will be replaced with .ffill() and .bfill()

Setting an item of incompatible dtype is deprecated

Details
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[<NA> 'VI' 'III6' <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>
 <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA> <NA>]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a'
 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a' 'a']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I'
 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I'
 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I'
 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I'
 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I'
 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'I' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i'
 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'i' 'iii' 'iii' 'iii'
 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii'
 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii'
 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii' 'iii'
 'iii']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['i' 'iv6' 'V' 'V64(#6b5)/V' 'V43(b5)/V' 'V7(#4)' 'V7' 'V64' 'V6' 'v6'
 'V64(6b5)/VII' 'V43(b5)/VII' 'V7(#4)/III' 'V7/III' 'VII64' 'VII6' 'vii6'
 'i' '#viio65(4)' 'V64(6)' 'V7(#4)/V' 'V7/V' '#viio65(4)' 'V64(6)'
 'V7(#4)/V' 'V7/V' 'V7(#8)' 'V7(9)' 'v7' 'V7' 'VI(11)' 'VI' 'V65/VII'
 'V(64)/III' 'vii%65/VII' 'V43/VII' 'V/III' 'V2/III' 'III6' 'VI6/iv'
 '#viio7/iv' 'iv(4)' 'iv' 'bII6/iv' 'bIIM65/iv' 'iio6/iv' 'V(4)/iv' 'V/iv'
 'V7/iv' '#viio7(#4)/ii' 'V6(#6)/ii' 'V65(b5)/ii' 'V(4)/V' 'V/V'
 'vii%43/V' '#iii64' 'V7' 'I(74#2)' 'I' 'vii%43/V' 'viio43/V' 'V6(#11)'
 'V6' '#iii7' 'V7(4)/ii' 'V/ii' 'V7(#13)/V' 'V7/V' 'viio2/V' 'viio7/V'
 'viio2(4)/V' 'viio2/V' 'V6/iv' 'V43/iv' 'iv6(#7#4)' 'iv6(#7)' 'iv6'
 'viio6/V' 'V64/V' 'ii%7/V' 'III64' '#viio7(4)' '#viio7' 'vii%65/VII'
 'V43/VII' 'V43(b5)/VII' 'V7/III' 'v6' 'viio64/III' 'V65/VI' 'iv64/iv'
 '#viio7/iv' 'V6/iv' '#viio7/iv' 'iv(4)' 'iv' 'viio6(b3)/III'
 'V43(b5)/III' 'vii%65(b3)/III' 'V7(#4)/VI' 'V7/VI' 'viio6(b3)/III'
 'V43(b5)/III' 'vii%65(b3)/III' 'V7(#4)/VI' 'V7/VI' '#viio6(b3)/iv'
 'V43(b5)/iv' '#viio65(b3)/iv' 'V7(#4)/VII' 'V7/VII' '#viio6(b3)/iv'
 'V43(b5)/iv' '#viio65(b3)/iv' 'V7(#4)/VII' 'V7/VII' 'viio6(b3)/V'
 'V43(b5)/V' 'viio65(b3)/V' 'V7(b9)/V' 'V7/V' 'viio6(b3)/V' 'V43(b5)/V'
 'viio65(b3)/V' 'V7(b9)/V' 'V7/V' 'viio65/V' 'V64(b9)/V' '#viio65/iii'
 'vii%7/V' 'V65/iii' 'V7/iii' 'I(#4)' 'I' 'vii%43/V' 'viio43/V' 'V6(#4)'
 'V6' 'iii7' 'V7(4)/ii' 'V/ii' 'V7(13)/V' 'V7/V' 'viio2/V' 'viio7/V'
 'V6(b9)/V' 'viio2(4)/V' 'viio2/V' 'I6' 'V43/IV' 'viio6/IV' 'V6(6)/vi'
 'vi' 'IV6' 'vii%65/V' 'v6(#6#4)' 'v6' 'V6' '#viio65/vi' 'iv6(6#4)' 'iv6'
 'V65/ii' 'V64' '#viio7(4)/iii' '#viio7/iii' 'V64(2)/ii' 'V64/ii' 'V43/ii'
 'V7/V' 'vii%43/V' 'V65' 'ii43' '#viio7/vi' 'V65/vi' '#viio7/vi' 'IV6'
 'ii64' 'V43/V' 'viio65/V' 'bIII64(13)' 'bIII64' 'bIII64(b6)'
 'V43(42)/bVII' 'V43(4)/bVII' 'V43/bVII' 'vii%7/bIII' 'viio7/bIII'
 'viio64/bVI' 'V2/bVI' 'bII6/IV' 'ii%7/IV' 'V64(4)/IV' 'viio7/IV' 'IV(4)'
 'V7/bVII' 'V6(b6b2)/V' 'V6/V' 'viio(b3)/V' 'V(4)' 'V' 'IV' 'ii6'
 'V7(#4#2)' 'V7' 'V7(9)' 'V' 'iii6' 'V+' 'I64' 'V' 'vi' 'IV64' 'V(6)' 'V7'
 'viio2' 'ii43' 'V7(#4)' 'V7' 'V' 'IV6' 'V(6)' 'V7' 'viio2' 'ii43'
 'V7(#4)' 'V7' 'V7(9)' 'V7' 'V7(b94)' 'V' 'V64(6b5)/VII' 'V43(b5)/VII'
 'V7(#11)/III' 'V7/III' 'V7(9)/III' 'V7/III' 'V7(9)/III' 'V7(b94)/III'
 'V/III' 'III(964)' 'III(4#2)' 'III' 'V7(#11)/V' 'V7/V' 'V7(#9)' 'V7' 'VI'
 'VI(4)' 'VI' 'viio65/V' 'III64' 'V43(42)/VII' 'V43(4)/VII' 'V43/VII'
 'V7(9)/III' 'iio6/III' '#viio65/iv' 'iv64/iv' 'iii7' 'iii2' 'viio7/bII'
 'ii%7/bII' 'iio64/bII' 'V7/bII' 'V7(b5)/bII' 'viio6(2)/bII'
 'V43(#7b52)/bII' 'V43(b5)/bII' 'V7/bV' 'ii%7/bV' 'iio6(#7)/bV' 'iio6/bV'
 'viio/bV' 'V64(#9)' 'V64' 'ii%7/bV' 'iio6/bV' 'V6' 'ii%7/bV' 'iio6/bV'
 'V7(b9)/bV' 'V6' 'ii%7/bV' 'V64(#6b5)/V' 'V43(b5)/V' 'V7(#4)' 'V7' 'V'
 'V(b9)' 'V6' 'v6' 'V64(6b5)/VII' 'V43(b5)/VII' 'V7(#4)/III' 'V7/III'
 'VII' 'VII(b2)' 'VII6' 'vii6' 'ii%7' 'V43(b5)' 'V7(#4)/iv' 'V7/iv'
 'viio6(b3)/III' 'V43(b5)/III' 'vii%65(b3)/III' 'V7(#4)/VI' 'V7/VI'
 '#viio6(b3)/iv' 'V43(b5)/iv' '#viio65(b3)/iv' 'V7(#4)/VII' 'V7/VII' 'iv6'
 'ii%43' 'iv65' 'V7(9)/V' 'V7' 'VI(11)' 'VI' 'iv' 'iio6' 'ii%65' 'iio6'
 '#viio43(#4)' '#viio43' 'v%43' 'vii6' 'v%43' '#vii%65' 'V43' 'V43(b5)'
 '#vii%65(b3)' '#viio2/iv' '#vi%7' '#vio' 'viio65(b3)/V' 'V7(94)' 'V7(9)'
 'V' 'V(9)' 'V7' '#viio43(4)' '#vii%43(4)' '#viio43(#7)' '#viio43' 'V'
 'V(9)' 'V' 'V64(6b5)/V' 'V43(b5)/V' 'V7(#4)' 'V7' 'iv6' 'V' 'i6' '#viio'
 'iv' 'iv6' 'V']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['i' 'iv' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'v' 'V' 'V' 'V' 'V' 'VII' 'VII'
 'vii' 'i' '#vii' 'V' 'V' 'V' '#vii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'v' 'V' 'VI' 'VI'
 'V' 'V' 'vii' 'V' 'V' 'V' 'III' 'VI' '#vii' 'iv' 'iv' 'bII' 'bII' 'ii'
 'V' 'V' 'V' '#vii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'vii' '#iii' 'V' 'I' 'I' 'vii' 'vii'
 'V' 'V' '#iii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'vii' 'vii' 'vii' 'vii' 'V' 'V' 'iv' 'iv'
 'iv' 'vii' 'V' 'ii' 'III' '#vii' '#vii' 'vii' 'V' 'V' 'V' 'v' 'vii' 'V'
 'iv' '#vii' 'V' '#vii' 'iv' 'iv' 'vii' 'V' 'vii' 'V' 'V' 'vii' 'V' 'vii'
 'V' 'V' '#vii' 'V' '#vii' 'V' 'V' '#vii' 'V' '#vii' 'V' 'V' 'vii' 'V'
 'vii' 'V' 'V' 'vii' 'V' 'vii' 'V' 'V' 'vii' 'V' '#vii' 'vii' 'V' 'V' 'I'
 'I' 'vii' 'vii' 'V' 'V' 'iii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'vii' 'vii' 'V' 'vii' 'vii'
 'I' 'V' 'vii' 'V' 'vi' 'IV' 'vii' 'v' 'v' 'V' '#vii' 'iv' 'iv' 'V' 'V'
 '#vii' '#vii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'vii' 'V' 'ii' '#vii' 'V' '#vii' 'IV' 'ii'
 'V' 'vii' 'bIII' 'bIII' 'bIII' 'V' 'V' 'V' 'vii' 'vii' 'vii' 'V' 'bII'
 'ii' 'V' 'vii' 'IV' 'V' 'V' 'V' 'vii' 'V' 'V' 'IV' 'ii' 'V' 'V' 'V' 'V'
 'iii' 'V' 'I' 'V' 'vi' 'IV' 'V' 'V' 'vii' 'ii' 'V' 'V' 'V' 'IV' 'V' 'V'
 'vii' 'ii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V'
 'III' 'III' 'III' 'V' 'V' 'V' 'V' 'VI' 'VI' 'VI' 'vii' 'III' 'V' 'V' 'V'
 'V' 'ii' '#vii' 'iv' 'iii' 'iii' 'vii' 'ii' 'ii' 'V' 'V' 'vii' 'V' 'V'
 'V' 'ii' 'ii' 'ii' 'vii' 'V' 'V' 'ii' 'ii' 'V' 'ii' 'ii' 'V' 'V' 'ii' 'V'
 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'v' 'V' 'V' 'V' 'V' 'VII' 'VII' 'VII' 'vii' 'ii'
 'V' 'V' 'V' 'vii' 'V' 'vii' 'V' 'V' '#vii' 'V' '#vii' 'V' 'V' 'iv' 'ii'
 'iv' 'V' 'V' 'VI' 'VI' 'iv' 'ii' 'ii' 'ii' '#vii' '#vii' 'v' 'vii' 'v'
 '#vii' 'V' 'V' '#vii' '#vii' '#vi' '#vi' 'vii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' '#vii'
 '#vii' '#vii' '#vii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'iv' 'V' 'i' '#vii' 'iv'
 'iv' 'V']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 'o' nan nan nan 'o' nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan '%' nan
 nan nan nan nan 'o' nan nan nan 'M' 'o' nan nan nan 'o' nan nan nan nan
 '%' nan nan nan nan '%' 'o' nan nan nan nan nan nan nan 'o' 'o' 'o' 'o'
 nan nan nan nan nan 'o' nan '%' nan 'o' 'o' '%' nan nan nan nan 'o' nan
 nan 'o' nan 'o' nan nan 'o' nan '%' nan nan 'o' nan '%' nan nan 'o' nan
 'o' nan nan 'o' nan 'o' nan nan 'o' nan 'o' nan nan 'o' nan 'o' nan nan
 'o' nan 'o' '%' nan nan nan nan '%' 'o' nan nan nan nan nan nan nan 'o'
 'o' nan 'o' 'o' nan nan 'o' nan nan nan '%' nan nan nan 'o' nan nan nan
 nan 'o' 'o' nan nan nan nan '%' nan nan 'o' nan 'o' nan nan nan 'o' nan
 nan nan nan nan nan '%' 'o' 'o' nan nan '%' nan 'o' nan nan nan nan 'o'
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan '+' nan nan nan nan nan nan 'o' nan
 nan nan nan nan nan nan 'o' nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan 'o' nan nan
 nan nan nan 'o' 'o' nan nan nan 'o' '%' 'o' nan nan 'o' nan nan nan '%'
 'o' 'o' 'o' nan nan '%' 'o' nan '%' 'o' nan nan '%' nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan '%' nan nan nan 'o' nan '%'
 nan nan 'o' nan 'o' nan nan nan '%' nan nan nan nan nan nan 'o' '%' 'o'
 'o' 'o' '%' nan '%' '%' nan nan '%' 'o' '%' 'o' 'o' nan nan nan nan nan
 'o' '%' 'o' 'o' nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan 'o' nan nan nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan '6' nan '64' '43' '7' '7' '64' '6' '6' '64' '43' '7' '7' '64' '6' '6'
 nan '65' '64' '7' '7' '65' '64' '7' '7' '7' '7' '7' '7' nan nan '65' nan
 '65' '43' nan '2' '6' '6' '7' nan nan '6' '65' '6' nan nan '7' '7' '6'
 '65' nan nan '43' '64' '7' nan nan '43' '43' '6' '6' '7' '7' nan '7' '7'
 '2' '7' '2' '2' '6' '43' '6' '6' '6' '6' '64' '7' '64' '7' '7' '65' '43'
 '43' '7' '6' '64' '65' '64' '7' '6' '7' nan nan '6' '43' '65' '7' '7' '6'
 '43' '65' '7' '7' '6' '43' '65' '7' '7' '6' '43' '65' '7' '7' '6' '43'
 '65' '7' '7' '6' '43' '65' '7' '7' '65' '64' '65' '7' '65' '7' nan nan
 '43' '43' '6' '6' '7' '7' nan '7' '7' '2' '7' '6' '2' '2' '6' '43' '6'
 '6' nan '6' '65' '6' '6' '6' '65' '6' '6' '65' '64' '7' '7' '64' '64'
 '43' '7' '43' '65' '43' '7' '65' '7' '6' '64' '43' '65' '64' '64' '64'
 '43' '43' '43' '7' '7' '64' '2' '6' '7' '64' '7' nan '7' '6' '6' nan nan
 nan nan '6' '7' '7' '7' nan '6' nan '64' nan nan '64' nan '7' '2' '43'
 '7' '7' nan '6' nan '7' '2' '43' '7' '7' '7' '7' '7' nan '64' '43' '7'
 '7' '7' '7' '7' '7' nan nan nan nan '7' '7' '7' '7' nan nan nan '65' '64'
 '43' '43' '43' '7' '6' '65' '64' '7' '2' '7' '7' '64' '7' '7' '6' '43'
 '43' '7' '7' '6' '6' nan '64' '64' '7' '6' '6' '7' '6' '7' '6' '7' '64'
 '43' '7' '7' nan nan '6' '6' '64' '43' '7' '7' nan nan '6' '6' '7' '43'
 '7' '7' '6' '43' '65' '7' '7' '6' '43' '65' '7' '7' '6' '43' '65' '7' '7'
 nan nan nan '6' '65' '6' '43' '43' '43' '6' '43' '65' '43' '43' '65' '2'
 '7' nan '65' '7' '7' nan nan '7' '43' '43' '43' '43' nan nan nan '64'
 '43' '7' '7' '6' nan '6' nan nan '6' nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan '#6b5' 'b5' '#4' nan nan nan nan '6b5' 'b5' '#4' nan nan nan
 nan nan '4' '6' '#4' nan '4' '6' '#4' nan '#8' '9' nan nan '11' nan nan
 '64' nan nan nan nan nan nan nan '4' nan nan nan nan '4' nan nan '#4'
 '#6' 'b5' '4' nan nan nan nan '74#2' nan nan nan '#11' nan nan '4' nan
 '#13' nan nan nan '4' nan nan nan '#7#4' '#7' nan nan nan nan nan '4' nan
 nan nan 'b5' nan nan nan nan nan nan nan nan '4' nan 'b3' 'b5' 'b3' '#4'
 nan 'b3' 'b5' 'b3' '#4' nan 'b3' 'b5' 'b3' '#4' nan 'b3' 'b5' 'b3' '#4'
 nan 'b3' 'b5' 'b3' 'b9' nan 'b3' 'b5' 'b3' 'b9' nan nan 'b9' nan nan nan
 nan '#4' nan nan nan '#4' nan nan '4' nan '13' nan nan nan 'b9' '4' nan
 nan nan nan '6' nan nan nan '#6#4' nan nan nan '6#4' nan nan nan '4' nan
 '2' nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan '13' nan 'b6'
 '42' '4' nan nan nan nan nan nan nan '4' nan '4' nan 'b6b2' nan 'b3' '4'
 nan nan nan '#4#2' nan '9' nan nan nan nan nan nan nan '6' nan nan nan
 '#4' nan nan nan '6' nan nan nan '#4' nan '9' nan 'b94' nan '6b5' 'b5'
 '#11' nan '9' nan '9' 'b94' nan '964' '4#2' nan '#11' nan '#9' nan nan
 '4' nan nan nan '42' '4' nan '9' nan nan nan nan nan nan nan nan nan 'b5'
 '2' '#7b52' 'b5' nan nan '#7' nan nan '#9' nan nan nan nan nan nan 'b9'
 nan nan '#6b5' 'b5' '#4' nan nan 'b9' nan nan '6b5' 'b5' '#4' nan nan
 'b2' nan nan nan 'b5' '#4' nan 'b3' 'b5' 'b3' '#4' nan 'b3' 'b5' 'b3'
 '#4' nan nan nan nan '9' nan '11' nan nan nan nan nan '#4' nan nan nan
 nan nan nan 'b5' 'b3' nan nan nan 'b3' '94' '9' nan '9' nan '4' '4' '#7'
 nan nan '9' nan '6b5' 'b5' '#4' nan nan nan nan nan nan nan nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan 'V' 'V' nan nan nan nan nan 'VII' 'VII' 'III' 'III' nan nan
 nan nan nan nan 'V' 'V' nan nan 'V' 'V' nan nan nan nan nan nan 'VII'
 'III' 'VII' 'VII' 'III' 'III' nan 'iv' 'iv' nan nan 'iv' 'iv' 'iv' 'iv'
 'iv' 'iv' 'ii' 'ii' 'ii' 'V' 'V' 'V' nan nan nan nan 'V' 'V' nan nan nan
 'ii' 'ii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'iv' 'iv' nan nan nan 'V' 'V' 'V' nan
 nan nan 'VII' 'VII' 'VII' 'III' nan 'III' 'VI' 'iv' 'iv' 'iv' 'iv' nan
 nan 'III' 'III' 'III' 'VI' 'VI' 'III' 'III' 'III' 'VI' 'VI' 'iv' 'iv'
 'iv' 'VII' 'VII' 'iv' 'iv' 'iv' 'VII' 'VII' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V'
 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'iii' 'V' 'iii' 'iii' nan nan 'V' 'V' nan nan nan
 'ii' 'ii' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' 'V' nan 'IV' 'IV' 'vi' nan nan 'V' nan
 nan nan 'vi' nan nan 'ii' nan 'iii' 'iii' 'ii' 'ii' 'ii' 'V' 'V' nan nan
 'vi' 'vi' 'vi' nan nan 'V' 'V' nan nan nan 'bVII' 'bVII' 'bVII' 'bIII'
 'bIII' 'bVI' 'bVI' 'IV' 'IV' 'IV' 'IV' nan 'bVII' 'V' 'V' 'V' nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan 'VII' 'VII' 'III' 'III' 'III'
 'III' 'III' 'III' 'III' nan nan nan 'V' 'V' nan nan nan nan nan 'V' nan
 'VII' 'VII' 'VII' 'III' 'III' 'iv' 'iv' nan nan 'bII' 'bII' 'bII' 'bII'
 'bII' 'bII' 'bII' 'bII' 'bV' 'bV' 'bV' 'bV' 'bV' nan nan 'bV' 'bV' nan
 'bV' 'bV' 'bV' nan 'bV' 'V' 'V' nan nan nan nan nan nan 'VII' 'VII' 'III'
 'III' nan nan nan nan nan nan 'iv' 'iv' 'III' 'III' 'III' 'VI' 'VI' 'iv'
 'iv' 'iv' 'VII' 'VII' nan nan nan 'V' nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan 'iv' nan nan 'V' nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan 'V' 'V' nan nan nan nan nan nan nan nan nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan nan nan nan '\\\\' nan nan nan nan nan nan '\\\\' nan nan nan
 nan nan nan nan '\\\\' nan nan nan '\\\\' nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan nan
 nan '\\\\']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['m' 'm' 'M' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' 'm' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M'
 'M' 'm' 'm' 'o7' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'o7' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'mm7'
 'Mm7' 'M' 'M' 'Mm7' 'M' '%7' 'Mm7' 'M' 'Mm7' 'M' 'M' 'o7' 'm' 'm' 'M'
 'MM7' 'o' 'M' 'M' 'Mm7' 'o7' 'M' 'Mm7' 'M' 'M' '%7' 'm' 'Mm7' 'M' 'M'
 '%7' 'o7' 'M' 'M' 'mm7' 'Mm7' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'o7' 'o7' 'o7' 'o7' 'M'
 'Mm7' 'm' 'm' 'm' 'o' 'M' '%7' 'M' 'o7' 'o7' '%7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'm'
 'o' 'Mm7' 'm' 'o7' 'M' 'o7' 'm' 'm' 'o' 'Mm7' '%7' 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'Mm7'
 '%7' 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'Mm7' 'o7' 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'Mm7' 'o7' 'Mm7' 'Mm7'
 'o' 'Mm7' 'o7' 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'Mm7' 'o7' 'Mm7' 'Mm7' 'o7' 'M' 'o7' '%7'
 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' '%7' 'o7' 'M' 'M' 'mm7' 'Mm7' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'o7'
 'o7' 'M' 'o7' 'o7' 'M' 'Mm7' 'o' 'M' 'm' 'M' '%7' 'm' 'm' 'M' 'o7' 'm'
 'm' 'Mm7' 'M' 'o7' 'o7' 'M' 'M' 'Mm7' 'Mm7' '%7' 'Mm7' 'mm7' 'o7' 'Mm7'
 'o7' 'M' 'm' 'Mm7' 'o7' 'M' 'M' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' '%7' 'o7' 'o' 'Mm7'
 'M' '%7' 'M' 'o7' 'M' 'Mm7' 'M' 'M' 'o' 'M' 'M' 'M' 'm' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7'
 'M' 'm' '+' 'M' 'M' 'm' 'M' 'M' 'Mm7' 'o7' 'mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' 'M'
 'Mm7' 'o7' 'mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7'
 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' 'M' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M'
 'M' 'o7' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'o7' 'm' 'mm7' 'mm7' 'o7' '%7'
 'o' 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' '%7' 'o' 'o' 'o' 'M' 'M' '%7' 'o'
 'M' '%7' 'o' 'Mm7' 'M' '%7' 'M' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' 'M' 'm' 'M'
 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' 'M' 'm' '%7' 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'Mm7' '%7'
 'Mm7' 'Mm7' 'o' 'Mm7' 'o7' 'Mm7' 'Mm7' 'm' '%7' 'mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M'
 'm' 'o' '%7' 'o' 'o7' 'o7' '%7' 'm' '%7' '%7' 'Mm7' 'Mm7' '%7' 'o7' '%7'
 'o' 'o7' 'Mm7' 'Mm7' 'M' 'M' 'Mm7' 'o7' '%7' 'o7' 'o7' 'M' 'M' 'M' 'M'
 'Mm7' 'Mm7' 'Mm7' 'm' 'M' 'm' 'o' 'm' 'm' 'M']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[ True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[ True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False False False False False False False False False False False
 False False  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True
  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True  True]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[(3, 0, 4) (-1, 3, 2) (4, 8, 5) (-1, 5, 9) (-1, 3, 5, 9) (4, 8, 10, 2)
 (4, 8, 5, 2) (5, 4, 8) (8, 5, 4) (1, 5, 4) (-4, 5, 2, 6) (-4, 0, 2, 6)
 (1, 5, 7, -1) (1, 5, 2, -1) (2, 1, 5) (5, 2, 1) (-2, 2, 1) (3, 0, 4)
 (0, 2, -1, 8) (0, 4, 8) (5, 9, 11, 3) (5, 9, 6, 3) (0, 2, -1, 8)
 (0, 4, 8) (5, 9, 11, 3) (5, 9, 6, 3) (4, 8, 5, 2) (4, 8, 5, 2)
 (4, 1, 5, 2) (4, 8, 5, 2) (-1, 3, 0) (-1, 3, 0) (6, 3, 0, 2) (1, 0, 4)
 (3, 0, 4, 6) (3, 0, 2, 6) (1, 5, 2) (-1, 1, 5, 2) (4, 1, 0) (2, -1, -2)
 (7, 4, 1, -2) (2, 1, 3) (2, -1, 3) (1, -2, -3) (1, -2, 2, -3) (1, -2, 4)
 (3, 2, 4) (3, 7, 4) (3, 7, 4, 1) (10, 7, 9, 1) (10, 7, 6) (10, 0, 4, 6)
 (5, 4, 6) (5, 9, 6) (3, 7, 9, 6) (8, 7, 4) (4, 8, 5, 2) (3, 12, 2, 4)
 (3, 7, 4) (3, 7, 9, 6) (3, 0, 9, 6) (8, 5, 4) (8, 5, 4) (7, 4, 8, 5)
 (6, 5, 7, 4) (6, 10, 7) (5, 9, 6, 3) (5, 9, 6, 3) (0, 9, 6, 3)
 (9, 6, 3, 0) (0, 9, 8, 3) (0, 9, 6, 3) (7, 4, 3) (4, 1, 3, 7) (-1, 8, 7)
 (-1, 3, 7) (-1, 3, 2) (6, 3, 9) (6, 5, 9) (6, 3, 0, 4) (1, 0, 4)
 (8, 0, 2, -1) (8, 5, 2, -1) (3, 0, 4, 6) (3, 0, 2, 6) (-4, 0, 2, 6)
 (1, 5, 2, -1) (1, 5, 4) (-1, 5, 2) (4, 1, -2, 0) (2, 1, -2) (7, 4, 1, -2)
 (7, 4, 3) (7, 4, 1, -2) (2, 1, 3) (2, -1, 3) (-5, -1, 5) (-5, -1, 1, 5)
 (-5, -1, 3, 5) (0, 4, 6, -2) (0, 4, 1, -2) (-5, -1, 5) (-5, -1, 1, 5)
 (-5, -1, 3, 5) (0, 4, 6, -2) (0, 4, 1, -2) (-3, 1, 7) (-3, 1, 3, 7)
 (-3, 1, -2, 7) (2, 6, 8, 0) (2, 6, 3, 0) (-3, 1, 7) (-3, 1, 3, 7)
 (-3, 1, -2, 7) (2, 6, 8, 0) (2, 6, 3, 0) (-1, 3, 9) (-1, 3, 5, 9)
 (-1, 3, 0, 9) (5, 9, 6, 3) (5, 9, 6, 3) (-1, 3, 9) (-1, 3, 5, 9)
 (-1, 3, 0, 9) (5, 9, 6, 3) (5, 9, 6, 3) (6, 3, 0, 9) (6, 5, 9)
 (9, 6, 3, 12) (9, 6, 3, 7) (12, 9, 6, 8) (8, 12, 9, 6) (3, 7, 9)
 (3, 7, 4) (3, 7, 9, 6) (3, 0, 9, 6) (8, 10, 4) (8, 5, 4) (7, 4, 8, 5)
 (6, 5, 7, 4) (6, 10, 7) (5, 9, 6, 3) (5, 9, 6, 3) (0, 9, 6, 3)
 (9, 6, 3, 0) (9, 6, 5) (0, 9, 8, 3) (0, 9, 6, 3) (7, 4, 3) (4, 1, 3, 7)
 (4, 1, 7) (11, 3, 7) (6, 3, 7) (6, 3, 2) (6, 3, 7, 9) (1, 10, 4)
 (1, 5, 4) (8, 5, 4) (8, 5, 2, 11) (-1, 15, 5, 2) (-1, 3, 2) (10, 7, 4, 6)
 (5, 4, 8) (12, 4, 6, 3) (12, 9, 6, 3) (7, 1, 10) (7, 6, 10) (7, 4, 6, 10)
 (5, 9, 6, 3) (3, 7, 9, 6) (8, 5, 2, 4) (6, 3, 5, 2) (11, 8, 5, 2)
 (11, 8, 5, 7) (11, 8, 5, 2) (6, 3, 2) (6, 5, 2) (6, 3, 5, 9) (6, 3, 0, 9)
 (1, 0, 4) (1, 0, 4) (-4, 0, 4) (3, 0, 4, 1) (3, 0, 2, 1) (3, 0, 2, 6)
 (5, 2, -1, 3) (5, 2, -1, -4) (-2, 4, 1) (-2, 0, 4, 1) (1, -2, -3)
 (4, 1, -2, 2) (4, 3, 2) (7, 4, 1, -2) (2, 8, 3) (2, 6, 3, 0) (9, 1, 0)
 (9, 6, 5) (9, -1, 3) (4, 3, 5) (4, 8, 5) (2, 6, 3) (2, 6, 5)
 (4, 13, 10, 2) (4, 8, 5, 2) (4, 8, 5, 2) (4, 8, 5) (4, 8, 7) (4, 8, 12)
 (4, 3, 7) (4, 8, 5) (6, 3, 7) (3, 2, 6) (4, 8, 7) (4, 8, 5, 2)
 (-1, 8, 5, 2) (6, 3, 5, 2) (4, 8, 10, 2) (4, 8, 5, 2) (4, 8, 5) (6, 3, 2)
 (4, 8, 7) (4, 8, 5, 2) (-1, 8, 5, 2) (6, 3, 5, 2) (4, 8, 10, 2)
 (4, 8, 5, 2) (4, 8, 5, 2) (4, 8, 5, 2) (4, 3, 5, 2) (4, 8, 5)
 (-4, 5, 2, 6) (-4, 0, 2, 6) (1, 5, 2, -1) (1, 5, 2, -1) (1, 5, 2, -1)
 (1, 5, 2, -1) (1, 5, 2, -1) (1, 0, 2, -1) (1, 5, 2) (0, -1, 3)
 (0, 9, -1, 1) (0, 4, 1) (5, 9, 6, 3) (5, 9, 6, 3) (4, 8, 5, 2)
 (4, 8, 5, 2) (-1, 3, 0) (-1, 5, 0) (-1, 3, 0) (6, 3, 0, 9) (1, 0, 4)
 (3, 0, 4, 1) (3, 0, 2, 1) (3, 0, 2, 6) (1, 5, 2, -1) (-1, -4, 2)
 (4, 1, -2, 7) (2, 1, -2) (0, -3, 1, -2) (-2, 0, -3, 1) (3, 0, -3, -6)
 (0, -3, -6, -2) (-6, 0, -3) (-1, 3, 0, -3) (-1, 3, -7, -3) (0, -3, -2)
 (-7, -3, 1, 4, 3) (-7, -3, -1, 3) (-2, 2, -1, -4) (-1, -4, -7, -3)
 (-4, -7, 4) (-4, -7, -1) (2, -1, -4) (5, 4, 8) (5, 4, 8) (-1, -4, -7, -3)
 (-4, -7, -1) (8, 5, 4) (-1, -4, -7, -3) (-4, -7, -1) (-2, 2, -1, -4)
 (8, 5, 4) (-1, -4, -7, -3) (-1, 5, 9) (-1, 3, 5, 9) (4, 8, 10, 2)
 (4, 8, 5, 2) (4, 8, 5) (4, 8, 5) (8, 5, 4) (1, 5, 4) (-4, 5, 2, 6)
 (-4, 0, 2, 6) (1, 5, 7, -1) (1, 5, 2, -1) (1, 5, 2) (-4, 5, 2) (5, 2, 1)
 (-2, 2, 1) (5, 2, -1, 3) (-2, 2, 4, 8) (3, 7, 9, 1) (3, 7, 4, 1)
 (-5, -1, 5) (-5, -1, 1, 5) (-5, -1, 3, 5) (0, 4, 6, -2) (0, 4, 1, -2)
 (-3, 1, 7) (-3, 1, 3, 7) (-3, 1, -2, 7) (2, 6, 8, 0) (2, 6, 3, 0)
 (-1, 3, 2) (-1, 3, 5, 2) (-1, 3, 0, 2) (5, 9, 6, 3) (4, 8, 5, 2)
 (-1, 3, 0) (-1, 3, 0) (-1, -4, 0) (-1, -4, 2) (-1, -4, 0, 2) (-1, -4, 2)
 (4, -4, 5, 2) (-1, -4, 5, 2) (-5, -1, 1, -2) (-5, -1, -2) (-5, -1, 1, -2)
 (2, -1, 3, 5) (2, -1, 1, 5) (-5, -1, 1, 5) (-5, -1, 3, 5) (-5, 4, 1, -2)
 (3, 0, -3, 1) (3, 0, -3) (-4, 0, -3, 6) (1, 0, 2, -1) (1, 5, 2, -1)
 (1, 5, 2) (1, 5, 2) (1, 5, 2, -1) (-1, -4, 5, -3) (-1, 3, 5, -3)
 (-1, -4, 3, 2) (-1, -4, 5, 2) (1, 5, 2) (1, 5, 2) (1, 5, 2) (-4, 5, 2, 6)
 (-4, 0, 2, 6) (1, 5, 7, -1) (1, 5, 2, -1) (-4, 0, -1) (1, 5, 2)
 (-3, 1, 0) (5, 2, -1) (-1, -4, 0) (-4, 0, -1) (1, 5, 2)]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[() () () (15,) () () () () () () () () () () () () () () () () () () ()
 () () () () (-1,) () () (5,) () () () () () () () () () () () () () () ()
 () () () () (9,) () () () () () () (1,) () () () (10,) () () () () (15,)
 () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () ()
 () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () ()
 () () () () (0,) () () () () (0,) () () (0,) () () () () () () () () ()
 () () () () (8,) () () () (0,) () () () () () () () () () (14,) () () ()
 () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () (3,) () () ()
 () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () (6,) () ()
 () () () () () () () () () () () () () () () () () () () (6,) () (-1,) ()
 () () (7,) () (3,) () (3,) (-4,) () (2,) () () (11,) () (6,) () () () ()
 () () () () () (3,) () () () () () () () () () () () () () () () () () ()
 (6,) () () () () () () (-7,) () () (15,) () () () () (-8,) () () () () ()
 () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () () (7,) ()
 (5,) () () () () () () () () () () () () () () () () () () (-4,) (-4,) ()
 (-4,) () () () () () () (-4,) () () () () () () () () () () () ()]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:406: FutureWarning: DataFrame.fillna with 'method' is deprecated and will raise in a future version. Use obj.ffill() or obj.bfill() instead.
  df.loc[:, key_cols] = df[key_cols].fillna(method='ffill')
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/expand_dcml.py:631: FutureWarning: Series.fillna with 'method' is deprecated and will raise in a future version. Use obj.ffill() or obj.bfill() instead.
  df[localkey].fillna(method="ffill", inplace=True)
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[<NA> <NA> <NA> ... <NA> <NA> <NA>]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['C' 'C' 'C' ... 'C' 'C' 'C']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['I' 'I' 'I' ... 'I' 'I' 'I']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan ... nan nan nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['I' 'IM2' 'vi7' ... 'I6' 'I64' 'I']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['I' 'I' 'vi' ... 'I' 'I' 'I']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan 'M' nan ... nan nan nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan '2' '7' ... '6' '64' nan]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[nan nan nan ... nan nan '\\\\']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '['M' 'MM7' 'mm7' ... 'M' 'M' 'M']' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[False False False ... False False False]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[(0, 4, 1) (5, 0, 4, 1) (3, 0, 4, 1) ... (4, 1, 0) (1, 0, 4) (0, 4, 1)]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:405: FutureWarning: Setting an item of incompatible dtype is deprecated and will raise in a future error of pandas. Value '[() () () ... () () ()]' has dtype incompatible with float64, please explicitly cast to a compatible dtype first.
  df.loc[select_dcml, exp.columns] = exp
/home/laser/miniconda3/lib/python3.11/site-packages/ms3/annotations.py:406: FutureWarning: DataFrame.fillna with 'method' is deprecated and will raise in a future version. Use obj.ffill() or obj.bfill() instead.
  df.loc[:, key_cols] = df[key_cols].fillna(method='ffill')

ms3 version

  • ms3 v2.2.1
  • pandas 2.1.0
@johentsch johentsch added the bug Something isn't working label Sep 5, 2023
@johentsch johentsch self-assigned this Sep 5, 2023
johentsch added a commit that referenced this issue Sep 19, 2023
Sign up for free to join this conversation on GitHub. Already have an account? Sign in to comment
Labels
bug Something isn't working
Projects
None yet
Development

No branches or pull requests

1 participant